Получите дескриптор используемого корневого макета, затем установите для него цвет фона. Корневой макет - это то, с помощью чего вы вызывали setContentView.
setContentView(R.layout.main);
// Now get a handle to any View contained // within the main layout you are using ViewsomeView= findViewById(R.id.randomViewInMainLayout);
// Find the root view Viewroot= someView.getRootView();
// Set the color root.setBackgroundColor(getResources().getColor(android.R.color.red));